背景介绍
磁珠是高通量测序过程必备产品,通过磁颗粒活性基团在一定条件下可与核酸结合和解离的原理,将样本中目的片段分离。可实现对核酸样本的高通量自动化操作,广泛应用于基因测序以及分子诊断领域。
商业化磁珠产品体系一般包含:磁珠、聚乙二醇(PEG)、盐离子等。基于SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization )技术, DNA在一定浓度的PEG存在条件下,NaCl或MgCl2促进条件下,DNA分子构象会发生急剧变化,会暴露出磷酸骨架上大量的带负电荷的磷酸基团,与表面带负电荷的羧基磁珠结合。带负电磷酸基团借由解离的盐离子(如Na+)与羧基形成离子桥,使DNA被特异性吸附到羧基磁珠表面。利用磁珠的磁性,可通过外加磁场进行收集洗脱,不同长度的DNA片段可以被选择性的沉淀出来。
图1. 磁珠结构示意图与磁珠吸附DNA原理示意图
产品描述
Hieff NGS® DNA Selection Beads基于SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization)原理,配合精心优化过的缓冲体系,可用于二代测序文库构建过程中的DNA片段分选、纯化。本产品可适用于各品牌的DNA、RNA建库试剂盒,和目前广泛使用的AMPure XP Beads使用方式相同,片段回收效率和文库大小分布均与AMPure XP Beads高度吻合。
产品特点
» 品质保证:采用进口原材料,品质高度稳定。
»无缝替换:产品原理,产品操作与实验结果与AMPure XP保持高度一致。
»兼容性高:兼容目前市面上所有的DNA/RNA建库试剂盒。
»批次稳定:严格的批次性能与稳定性质控,单次能产20L。
操作流程
图2. DNA分选操作示意图
性能展示
» 回收效率与XP高度一致
相同小牛胸腺基因组DNA,分别使用Yeasen磁珠与进口XP磁珠,在不同分选比列条件下, 片段大小与回收产量高度一致。
品牌 | 磁珠比例 | 测试值1 | 测试值2 | 平均值 | 回收效率对比 |
XP | 1.8x | 14.4 | 14.8 | 14.6 | 0.99 |
Yeasen | 14.8 | 14 .8 | 14.8 | ||
XP | 0.8x | 13.2 | 13.1 | 13.15 | 1.04 |
Yeasen | 12.5 | 12.7 | 12.6 | ||
XP | 0.6x | 10.7 | 9.18 | 9.94 | 0.91 |
Yeasen | 11.0 | 10.8 | 10.9 | ||
XP | 0.5x | 9.26 | 9.88 | 9.57 | 1.27 |
Yeasen | 6.58 | 8.46 | 7.52 |
» 分选效果与XP一致
利用模式样本,用XP磁珠和Yeasen磁珠做平行实验,Yeasen磁珠分选效果与Beckman磁珠对比,二者回收效率,分选片段大小基本一致。
图3. 磁珠分选效果与AMPure XP磁珠对比
» 批次间稳定性好
Yeasen三个批次磁珠的回收效率高度一致,批间稳定性佳。
样本 | 测试人 | Input(ng) | 纯化(1.8×) | ||
纯化后(ng) | 回收率% | 平均回收率 | |||
B-YS | 测试人1 | 169.5 | 159.75 | 94.25% | 94.5% |
C-YS | 162 | 95.58% | |||
D-YS | 158.75 | 93.66% | |||
B-YS | 测试人2 | 169.5 | 155 | 91.45% | 91.94% |
C-YS | 154.25 | 91% | |||
D-YS | 158.25 | 93.36% |
» 性价比更高
相同规格产品,Yeasen磁珠价格远低于AMPure XP价格,性价比更高。
价格对比
图4. Yeasen磁珠与AMPure XP磁珠价格对比
订购信息
类型 | 名称 | 货号 | 规格 |
完美替换XP | 12601ES03 | 1 mL | |
12601ES08 | 5 mL | ||
12601ES56 | 60 mL | ||
12601ES75 | 450 mL |
HB210802